Guix-HPC Activity Report 2022–2023

Rapport d’activités Guix-HPC 2022–2023

Céline Acary-Robert (1) , Emmanuel Agullo (2) , Ludovic Courtès (3) , Marek Felšöci (4) , Konrad Hinsen (5, 6) , Arun Isaac (7) , Ontje Lünsdorf (8) , Pjotr Prins (9) , Simon Tournier (10) , Philippe Virouleau (11) , Ricardo Wurmus (12)

1 AIRSEA - Mathematics and computing applied to oceanic and atmospheric flows
2 CONCACE - COmposabilité Numerique and parallèle pour le CAlcul haute performanCE
3 SED - Service Expérimentation et Développement [Bordeaux]
4 CAMUS - Compilation pour les Architectures MUlti-coeurS
5 SSOLEIL - Synchrotron SOLEIL
6 CBM - Centre de biophysique moléculaire
7 UCL - University College of London [London]
8 Institute of Networked Energy Systems
9 UTHSC - The University of Tennessee Health Science Center [Memphis]
10 UPCité - Université Paris Cité
11 Inria Grenoble - Rhône-Alpes
12 Max Delbrueck Center for Molecular Medicine

Guix-HPC is a collaborative effort to bring reproducible software deployment to scientific workflows and high-performance computing (HPC). Guix-HPC builds upon the GNU Guix software deployment tool and aims to make it a better tool for HPC practitioners and scientists concerned with reproducible research. This report highlights key achievements of Guix-HPC since our previous report a year ago, including the organization of a three-day workshop and significant expansions of the package collection for GPU computing and for bioinformatics.

Guix-HPC est un travail collaboratif pour donner les moyens du déploiement logiciel reproductible aux travaux scientifiques et au calcul intensif (HPC). Guix-HPC repose sur l'outil de déploiement logiciel GNU Guix et a pour ambition d’en faire un meilleur outil pour le calcul intensif et pour les scientifiques souhaitant faire des travaux de recherche reproductibles. Ce rapport souligne les réalisations clef de Guix-HPC depuis le précédent rapport un an plus tôt, avec notamment l’organisation d’un atelier de trois jours et des ajouts significatifs à l’ensemble des logiciels fournis, en particulier pour l’utilisation des GPU et pour la bioinformatique.

Keywords: Open Science; HPC; Software Deployment; Reproducibililty

Domains: Computer Science [cs]; Distributed, Parallel, and Cluster Computing [cs.DC]; Operating Systems [cs.OS]; Software Engineering [cs.SE]

Céline Acary-Robert, Emmanuel Agullo, Ludovic Courtès, Marek Felšöci, Konrad Hinsen, et al.. Guix-HPC Activity Report 2022–2023. Inria Bordeaux - Sud Ouest. 2024, pp.1-32. ⟨hal-04500140⟩